Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PICALMQ13492 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
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