Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXE3Q13461 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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