Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PDE3BQ13370 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDE3BQ13370 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDE3BQ13370 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
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