Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3BPQ13352 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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