Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMQ13315 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMQ13315 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMQ13315 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMQ13315 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMQ13315 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMQ13315 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMQ13315 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMQ13315 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMQ13315 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMQ13315 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMQ13315 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMQ13315 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMQ13315 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMQ13315 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMQ13315 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMQ13315 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMQ13315 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMQ13315 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMQ13315 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMQ13315 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMQ13315 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMQ13315 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMQ13315 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMQ13315 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMQ13315 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATMQ13315 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATMQ13315 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATMQ13315 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATMQ13315 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMQ13315 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMQ13315 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMQ13315 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATMQ13315 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATMQ13315 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATMQ13315 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATMQ13315 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATMQ13315 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATMQ13315 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATMQ13315 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATMQ13315 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATMQ13315 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATMQ13315 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATMQ13315 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATMQ13315 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATMQ13315 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATMQ13315 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATMQ13315 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATMQ13315 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATMQ13315 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATMQ13315 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATMQ13315 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATMQ13315 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATMQ13315 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATMQ13315 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATMQ13315 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATMQ13315 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATMQ13315 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATMQ13315 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATMQ13315 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATMQ13315 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATMQ13315 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATMQ13315 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATMQ13315 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATMQ13315 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATMQ13315 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATMQ13315 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATMQ13315 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATMQ13315 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATMQ13315 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATMQ13315 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATMQ13315 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATMQ13315 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATMQ13315 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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