Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPA4Q13156 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA4Q13156 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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