Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF1Q13077 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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