Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECH1Q13011 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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