Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP1Q12981 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNIP1Q12981 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNIP1Q12981 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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