Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.73e-10■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-10■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.193e-10■■□□□ 13
GRSF1Q12849 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.229e-7■■□□□ 13
GRSF1Q12849 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 324.22■■□□□ 1.479e-15■■□□□ 13
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GRSF1Q12849 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 324.7■■□□□ 1.542e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.352e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.292e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PICALM-210ENST00000528411 586 ntTSL 515.82■□□□□ 0.122e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PICALM-203ENST00000525162 548 ntTSL 48.01□□□□□ -1.132e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 45.8□□□□□ -1.482e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 55.57□□□□□ -1.522e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.882e-8■■□□□ 13
GRSF1Q12849 FKBP2-204ENST00000535135 639 ntTSL 325.92■■□□□ 1.742e-7■■□□□ 13
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GRSF1Q12849 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 222.06■■□□□ 1.124e-17■■□□□ 13
GRSF1Q12849 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 220.75■□□□□ 0.914e-17■■□□□ 13
GRSF1Q12849 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-17■■□□□ 13
GRSF1Q12849 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.274e-17■■□□□ 13
GRSF1Q12849 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 412.35□□□□□ -0.434e-17■■□□□ 13
GRSF1Q12849 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 28.96□□□□□ -0.984e-17■■□□□ 13
GRSF1Q12849 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.884e-17■■□□□ 13
GRSF1Q12849 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.084e-14■■□□□ 12.9
GRSF1Q12849 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.664e-14■■□□□ 12.9
GRSF1Q12849 APOL1-202ENST00000397278 2918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.799e-12■■□□□ 12.9
GRSF1Q12849 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.839e-12■■□□□ 12.9
GRSF1Q12849 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.919e-12■■□□□ 12.9
GRSF1Q12849 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.919e-12■■□□□ 12.9
GRSF1Q12849 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.929e-12■■□□□ 12.9
GRSF1Q12849 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.941e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RNF8-207ENST00000494320 977 ntTSL 525.88■■□□□ 1.731e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AURKAIP1-205ENST00000489799 695 ntTSL 1 (best)25.07■■□□□ 1.61e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.352e-12■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RNF8-203ENST00000469316 608 ntTSL 422.99■■□□□ 1.271e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.251e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.152e-12■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RNF8-201ENST00000229866 2124 ntTSL 220.89■□□□□ 0.941e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLXIPL-207ENST00000453275 690 ntTSL 520.74■□□□□ 0.911e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.91e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RNF8-205ENST00000479516 1525 ntTSL 1 (best)20.58■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AURKAIP1-206ENST00000496905 608 ntTSL 219.56■□□□□ 0.721e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HSF1-214ENST00000614796 1724 ntTSL 519.26■□□□□ 0.672e-12■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.661e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 ANO9-207ENST00000532094 5487 ntTSL 217.84■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HSF1-202ENST00000527328 2336 ntTSL 217.81■□□□□ 0.442e-12■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 ANO9-206ENST00000528927 2639 ntTSL 1 (best)16.81■□□□□ 0.281e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLXIPL-210ENST00000476404 1921 ntTSL 215.82■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.351e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HSF1-210ENST00000532338 3451 ntTSL 212.75□□□□□ -0.372e-12■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 312.3□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLXIPL-211ENST00000488212 534 ntTSL 210.8□□□□□ -0.681e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.931e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.081e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.121e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.321e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RNF8-206ENST00000487950 731 ntTSL 45.62□□□□□ -1.511e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.277e-7■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.843e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MPND-204ENST00000594716 1547 ntTSL 1 (best)32.7■■■□□ 2.833e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MPND-205ENST00000596722 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 232.61■■■□□ 2.813e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MPND-206ENST00000597036 1445 ntTSL 530.62■■■□□ 2.493e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.423e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HDAC11-207ENST00000405478 799 ntTSL 528.42■■■□□ 2.143e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.023e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HDAC11-217ENST00000475818 1271 ntTSL 322.15■■□□□ 1.143e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.133e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.933e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.93e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HDAC11-216ENST00000458642 574 ntTSL 519.95■□□□□ 0.783e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.683e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.313e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MCF2L-228ENST00000487354 553 ntTSL 316.63■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HDAC11-210ENST00000425430 1021 ntTSL 216.37■□□□□ 0.213e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.083e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-8■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-8■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MCF2L-205ENST00000397017 3903 ntTSL 514.86□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 LAP3-205ENST00000508014 494 ntTSL 414.81□□□□□ -0.041e-8■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-8■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-8■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-8■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 LAP3-207ENST00000509583 887 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.51e-8■■□□□ 12.8
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