Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NUP160Q12769 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
NUP160Q12769 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
NUP160Q12769 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NUP160Q12769 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NUP160Q12769 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms