Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC173Q0VFZ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms