Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC15Q0P6D6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC15Q0P6D6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms