Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF543Q08ER8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF543Q08ER8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms