Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A11Q08AI6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC38A11Q08AI6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms