Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUDPQ08623 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUDPQ08623 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PUDPQ08623 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PUDPQ08623 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUDPQ08623 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUDPQ08623 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUDPQ08623 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUDPQ08623 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUDPQ08623 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUDPQ08623 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUDPQ08623 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUDPQ08623 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUDPQ08623 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUDPQ08623 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUDPQ08623 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUDPQ08623 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUDPQ08623 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUDPQ08623 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PUDPQ08623 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUDPQ08623 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUDPQ08623 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUDPQ08623 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUDPQ08623 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUDPQ08623 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUDPQ08623 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUDPQ08623 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUDPQ08623 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUDPQ08623 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUDPQ08623 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms