Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 CUP1-2YHR055C 186 nt7.29□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt7.29□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 PGA2YNL149C 390 nt7.29□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 LTO1YNL260C 597 nt7.29□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 PSH1YOL054W 1221 nt7.29□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 MED8YBR193C 672 nt7.29□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 NUP53YMR153W 1428 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 CDC23YHR166C 1881 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 PPH21YDL134C 1110 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 BIM1YER016W 1035 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 IST3YIR005W 447 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 OSW5YMR148W 447 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 YPL102CYPL102C 303 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 CSH1YBR161W 1131 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 LDH1YBR204C 1128 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 AIM17YHL021C 1398 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 ALG1YBR110W 1350 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 CTF3YLR381W 2202 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 RAD7YJR052W 1698 nt7.28□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 YKR018CYKR018C 2178 nt7.27□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 ERR3YMR323W 1314 nt7.27□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 ERR1YOR393W 1314 nt7.27□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 ERR2YPL281C 1314 nt7.27□□□□□ -1.24
HDA3Q06623 BDS1YOL164W 1941 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 HTB1YDR224C 396 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 BMH1YER177W 804 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 KEG1YFR042W 603 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 GTS1YGL181W 1191 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 CCE1YKL011C 1062 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 GPN3YLR243W 819 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 PRE7YBL041W 726 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 RUF20RUF20 443 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YMR253CYMR253C 1245 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 NOP13YNL175C 1212 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 TEX1YNL253W 1269 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 CAF40YNL288W 1122 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 ERV2YPR037C 591 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 CRP1YHR146W 1398 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 ICL2YPR006C 1728 nt7.27□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 VPS72YDR485C 2388 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 SET4YJL105W 1683 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 RNH202YDR279W 1053 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 MHR1YDR296W 681 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 HGH1YGR187C 1185 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 MRT4YKL009W 711 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 FUS3YBL016W 1062 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 BUD21YOR078W 645 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 ATP4YPL078C 735 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YPT10YBR264C 600 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 SDH8YBR269C 417 nt7.26□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 FKH1YIL131C 1455 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YDL124WYDL124W 939 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YDR327WYDR327W 327 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 BTN2YGR142W 1233 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 CMC1YKL137W 336 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 PRY2YKR013W 990 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 SUR7YML052W 909 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 INP1YMR204C 1263 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 PRE5YMR314W 705 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YBR013CYBR013C 390 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 SME1YOR159C 285 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 GET4YOR164C 939 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 LDB16YCL005W 771 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 RMD8YFR048W 1989 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 HXT13YEL069C 1695 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 MSS51YLR203C 1311 nt7.25□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 PET494YNR045W 1470 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 LAP2YNL045W 2016 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 MSS2YDL107W 1056 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 INO2YDR123C 915 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 PRE1YER012W 597 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YGL230CYGL230C 444 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YGL260WYGL260W 231 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 PSF2YJL072C 642 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 NCA3YJL116C 1014 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 KRE9YJL174W 831 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YLR456WYLR456W 615 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 STE50YCL032W 1041 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 MTF2YDL044C 1323 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 AFG3YER017C 2286 nt7.24□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 MUP3YHL036W 1641 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 CHL4YDR254W 1377 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 BAP3YDR046C 1815 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 CPR1YDR155C 489 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YDR476CYDR476C 675 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YIL089WYIL089W 618 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 RCN1YKL159C 636 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 MRPS17YMR188C 714 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YOR292CYOR292C 930 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 ENV7YPL236C 1095 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 CUS1YMR240C 1311 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 PRB1YEL060C 1908 nt7.23□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 AFG2YLR397C 2343 nt7.22□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 IRC22YEL001C 678 nt7.22□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YER137CYER137C 447 nt7.22□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 YKL147CYKL147C 618 nt7.22□□□□□ -1.25
HDA3Q06623 DPH5YLR172C 903 nt7.22□□□□□ -1.25
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