Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD51Q06609 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms