Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RING1Q06587 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RING1Q06587 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RING1Q06587 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RING1Q06587 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RING1Q06587 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RING1Q06587 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RING1Q06587 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RING1Q06587 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RING1Q06587 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RING1Q06587 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RING1Q06587 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RING1Q06587 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RING1Q06587 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RING1Q06587 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RING1Q06587 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RING1Q06587 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RING1Q06587 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RING1Q06587 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RING1Q06587 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RING1Q06587 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RING1Q06587 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RING1Q06587 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RING1Q06587 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RING1Q06587 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RING1Q06587 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RING1Q06587 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RING1Q06587 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RING1Q06587 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RING1Q06587 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RING1Q06587 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RING1Q06587 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RING1Q06587 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RING1Q06587 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RING1Q06587 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RING1Q06587 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RING1Q06587 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RING1Q06587 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RING1Q06587 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RING1Q06587 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RING1Q06587 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RING1Q06587 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RING1Q06587 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RING1Q06587 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RING1Q06587 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RING1Q06587 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RING1Q06587 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RING1Q06587 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RING1Q06587 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RING1Q06587 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RING1Q06587 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RING1Q06587 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RING1Q06587 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RING1Q06587 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RING1Q06587 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RING1Q06587 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RING1Q06587 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RING1Q06587 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RING1Q06587 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RING1Q06587 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RING1Q06587 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RING1Q06587 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RING1Q06587 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RING1Q06587 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RING1Q06587 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RING1Q06587 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RING1Q06587 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RING1Q06587 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RING1Q06587 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RING1Q06587 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RING1Q06587 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RING1Q06587 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RING1Q06587 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RING1Q06587 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RING1Q06587 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RING1Q06587 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RING1Q06587 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RING1Q06587 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RING1Q06587 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms