Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELQ04864 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELQ04864 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELQ04864 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELQ04864 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELQ04864 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELQ04864 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELQ04864 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELQ04864 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELQ04864 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELQ04864 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RELQ04864 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RELQ04864 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RELQ04864 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RELQ04864 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RELQ04864 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RELQ04864 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RELQ04864 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RELQ04864 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RELQ04864 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELQ04864 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELQ04864 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELQ04864 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELQ04864 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELQ04864 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELQ04864 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELQ04864 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELQ04864 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RELQ04864 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RELQ04864 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms