Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFF2Q03403 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFF2Q03403 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms