Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4A11Q02928 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP4A11Q02928 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP4A11Q02928 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP4A11Q02928 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4A11Q02928 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4A11Q02928 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms