Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB1Q02641 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB1Q02641 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB1Q02641 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms