Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFKPQ01813 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFKPQ01813 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFKPQ01813 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms