Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAP1Q01518 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP1Q01518 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms