Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMP22Q01453 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms