Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF9Q00978 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms