Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSF1Q00613 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms