Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK16Q00536 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK16Q00536 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms