Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK6Q00534 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms