Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBP5P82980 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP5P82980 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP5P82980 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP5P82980 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP5P82980 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP5P82980 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP5P82980 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP5P82980 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP5P82980 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP5P82980 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBP5P82980 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBP5P82980 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBP5P82980 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBP5P82980 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBP5P82980 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBP5P82980 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBP5P82980 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP5P82980 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP5P82980 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP5P82980 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP5P82980 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP5P82980 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP5P82980 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP5P82980 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP5P82980 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP5P82980 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP5P82980 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP5P82980 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP5P82980 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP5P82980 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP5P82980 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP5P82980 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP5P82980 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP5P82980 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP5P82980 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP5P82980 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP5P82980 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP5P82980 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP5P82980 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP5P82980 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP5P82980 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP5P82980 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP5P82980 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP5P82980 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP5P82980 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP5P82980 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP5P82980 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP5P82980 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP5P82980 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBP5P82980 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP5P82980 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP5P82980 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP5P82980 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP5P82980 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP5P82980 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP5P82980 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP5P82980 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP5P82980 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP5P82980 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP5P82980 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP5P82980 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP5P82980 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP5P82980 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP5P82980 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP5P82980 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP5P82980 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP5P82980 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP5P82980 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP5P82980 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP5P82980 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP5P82980 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP5P82980 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP5P82980 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP5P82980 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP5P82980 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP5P82980 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP5P82980 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP5P82980 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP5P82980 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms