Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPS25P82663 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS25P82663 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS25P82663 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms