Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX4P78413 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX4P78413 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX4P78413 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX4P78413 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX4P78413 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX4P78413 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX4P78413 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX4P78413 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX4P78413 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX4P78413 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX4P78413 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX4P78413 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX4P78413 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX4P78413 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX4P78413 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX4P78413 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX4P78413 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX4P78413 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX4P78413 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX4P78413 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX4P78413 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX4P78413 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX4P78413 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX4P78413 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX4P78413 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX4P78413 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX4P78413 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX4P78413 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX4P78413 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX4P78413 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX4P78413 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX4P78413 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX4P78413 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX4P78413 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX4P78413 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX4P78413 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX4P78413 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX4P78413 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX4P78413 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX4P78413 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX4P78413 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX4P78413 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX4P78413 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX4P78413 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX4P78413 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX4P78413 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX4P78413 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX4P78413 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX4P78413 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX4P78413 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX4P78413 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX4P78413 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX4P78413 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX4P78413 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX4P78413 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX4P78413 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX4P78413 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX4P78413 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX4P78413 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX4P78413 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX4P78413 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX4P78413 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX4P78413 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX4P78413 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX4P78413 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX4P78413 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX4P78413 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX4P78413 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX4P78413 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX4P78413 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX4P78413 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX4P78413 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX4P78413 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX4P78413 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX4P78413 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX4P78413 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX4P78413 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX4P78413 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX4P78413 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms