Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
IRX6P78412 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IRX6P78412 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
IRX6P78412 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
IRX6P78412 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IRX6P78412 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
IRX6P78412 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
IRX6P78412 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
IRX6P78412 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
IRX6P78412 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IRX6P78412 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IRX6P78412 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IRX6P78412 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IRX6P78412 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IRX6P78412 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IRX6P78412 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IRX6P78412 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IRX6P78412 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IRX6P78412 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IRX6P78412 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
IRX6P78412 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IRX6P78412 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IRX6P78412 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
IRX6P78412 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
IRX6P78412 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
IRX6P78412 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
IRX6P78412 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IRX6P78412 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IRX6P78412 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
IRX6P78412 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
IRX6P78412 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IRX6P78412 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
IRX6P78412 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
IRX6P78412 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
IRX6P78412 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
IRX6P78412 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
IRX6P78412 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
IRX6P78412 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
IRX6P78412 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
IRX6P78412 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
IRX6P78412 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
IRX6P78412 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
IRX6P78412 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IRX6P78412 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IRX6P78412 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IRX6P78412 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IRX6P78412 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IRX6P78412 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IRX6P78412 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IRX6P78412 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IRX6P78412 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
IRX6P78412 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
IRX6P78412 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
IRX6P78412 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
IRX6P78412 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IRX6P78412 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IRX6P78412 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
IRX6P78412 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IRX6P78412 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IRX6P78412 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IRX6P78412 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IRX6P78412 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IRX6P78412 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IRX6P78412 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IRX6P78412 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IRX6P78412 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IRX6P78412 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IRX6P78412 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IRX6P78412 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
IRX6P78412 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IRX6P78412 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
IRX6P78412 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
IRX6P78412 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IRX6P78412 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
IRX6P78412 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IRX6P78412 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
IRX6P78412 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IRX6P78412 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
IRX6P78412 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IRX6P78412 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IRX6P78412 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IRX6P78412 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IRX6P78412 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IRX6P78412 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IRX6P78412 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IRX6P78412 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IRX6P78412 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IRX6P78412 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IRX6P78412 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IRX6P78412 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
IRX6P78412 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IRX6P78412 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IRX6P78412 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IRX6P78412 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IRX6P78412 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IRX6P78412 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IRX6P78412 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
IRX6P78412 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IRX6P78412 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IRX6P78412 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms