Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL30P62888 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL30P62888 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL30P62888 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL30P62888 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL30P62888 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL30P62888 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL30P62888 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL30P62888 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL30P62888 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL30P62888 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL30P62888 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL30P62888 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL30P62888 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL30P62888 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL30P62888 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL30P62888 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL30P62888 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL30P62888 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL30P62888 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL30P62888 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL30P62888 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL30P62888 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL30P62888 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL30P62888 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL30P62888 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL30P62888 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL30P62888 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL30P62888 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL30P62888 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL30P62888 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL30P62888 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL30P62888 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL30P62888 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL30P62888 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL30P62888 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL30P62888 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL30P62888 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL30P62888 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL30P62888 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL30P62888 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL30P62888 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL30P62888 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms