Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM3P62310 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM3P62310 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM3P62310 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM3P62310 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM3P62310 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSM3P62310 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSM3P62310 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM3P62310 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM3P62310 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM3P62310 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM3P62310 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM3P62310 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSM3P62310 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM3P62310 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM3P62310 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM3P62310 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM3P62310 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM3P62310 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM3P62310 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM3P62310 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM3P62310 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSM3P62310 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSM3P62310 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM3P62310 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM3P62310 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM3P62310 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM3P62310 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM3P62310 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSM3P62310 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LSM3P62310 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LSM3P62310 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM3P62310 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM3P62310 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM3P62310 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM3P62310 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM3P62310 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM3P62310 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM3P62310 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM3P62310 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM3P62310 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM3P62310 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM3P62310 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM3P62310 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM3P62310 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM3P62310 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM3P62310 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM3P62310 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM3P62310 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM3P62310 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms