Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFM1P61960 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFM1P61960 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFM1P61960 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFM1P61960 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFM1P61960 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFM1P61960 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFM1P61960 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFM1P61960 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFM1P61960 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFM1P61960 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFM1P61960 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFM1P61960 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFM1P61960 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFM1P61960 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFM1P61960 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFM1P61960 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UFM1P61960 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFM1P61960 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFM1P61960 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UFM1P61960 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFM1P61960 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFM1P61960 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFM1P61960 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFM1P61960 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFM1P61960 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFM1P61960 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFM1P61960 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFM1P61960 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFM1P61960 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFM1P61960 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFM1P61960 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFM1P61960 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFM1P61960 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFM1P61960 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFM1P61960 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFM1P61960 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFM1P61960 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFM1P61960 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFM1P61960 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFM1P61960 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFM1P61960 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFM1P61960 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFM1P61960 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFM1P61960 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFM1P61960 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFM1P61960 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UFM1P61960 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFM1P61960 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UFM1P61960 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFM1P61960 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFM1P61960 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFM1P61960 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFM1P61960 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFM1P61960 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFM1P61960 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFM1P61960 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFM1P61960 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFM1P61960 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UFM1P61960 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFM1P61960 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFM1P61960 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFM1P61960 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFM1P61960 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFM1P61960 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFM1P61960 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFM1P61960 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms