Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOAP61586 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOAP61586 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOAP61586 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOAP61586 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOAP61586 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOAP61586 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOAP61586 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOAP61586 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOAP61586 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOAP61586 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOAP61586 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOAP61586 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOAP61586 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOAP61586 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOAP61586 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOAP61586 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOAP61586 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOAP61586 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOAP61586 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOAP61586 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOAP61586 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOAP61586 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOAP61586 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOAP61586 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOAP61586 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOAP61586 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOAP61586 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOAP61586 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOAP61586 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOAP61586 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOAP61586 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOAP61586 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOAP61586 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOAP61586 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOAP61586 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOAP61586 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOAP61586 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOAP61586 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOAP61586 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOAP61586 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOAP61586 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOAP61586 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOAP61586 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOAP61586 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOAP61586 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOAP61586 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOAP61586 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOAP61586 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOAP61586 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOAP61586 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOAP61586 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOAP61586 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOAP61586 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOAP61586 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOAP61586 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOAP61586 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOAP61586 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOAP61586 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOAP61586 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOAP61586 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms