Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEFSECP57772 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms