Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBASH3AP57075 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBASH3AP57075 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms