Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTBP2P56545 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTBP2P56545 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms