Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXCT1P55809 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXCT1P55809 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms