Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL23P55773 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL23P55773 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL23P55773 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL23P55773 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL23P55773 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL23P55773 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL23P55773 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL23P55773 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL23P55773 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCL23P55773 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCL23P55773 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL23P55773 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCL23P55773 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL23P55773 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL23P55773 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL23P55773 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL23P55773 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL23P55773 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL23P55773 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL23P55773 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL23P55773 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL23P55773 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL23P55773 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL23P55773 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL23P55773 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL23P55773 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL23P55773 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL23P55773 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL23P55773 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL23P55773 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL23P55773 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL23P55773 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL23P55773 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL23P55773 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL23P55773 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL23P55773 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL23P55773 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCL23P55773 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCL23P55773 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL23P55773 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL23P55773 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL23P55773 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL23P55773 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL23P55773 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL23P55773 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL23P55773 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL23P55773 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL23P55773 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL23P55773 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL23P55773 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL23P55773 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL23P55773 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL23P55773 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL23P55773 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL23P55773 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL23P55773 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL23P55773 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL23P55773 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL23P55773 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL23P55773 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL23P55773 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL23P55773 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL23P55773 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL23P55773 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL23P55773 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL23P55773 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL23P55773 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL23P55773 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL23P55773 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL23P55773 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL23P55773 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL23P55773 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL23P55773 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL23P55773 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL23P55773 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL23P55773 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL23P55773 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL23P55773 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL23P55773 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms