Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH15P55291 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH15P55291 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH15P55291 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH15P55291 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH15P55291 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH15P55291 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH15P55291 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH15P55291 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH15P55291 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH15P55291 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH15P55291 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH15P55291 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH15P55291 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH15P55291 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH15P55291 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH15P55291 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH15P55291 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH15P55291 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH15P55291 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH15P55291 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH15P55291 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH15P55291 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH15P55291 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH15P55291 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH15P55291 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH15P55291 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH15P55291 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH15P55291 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH15P55291 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH15P55291 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH15P55291 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH15P55291 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH15P55291 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH15P55291 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH15P55291 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH15P55291 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH15P55291 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH15P55291 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH15P55291 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH15P55291 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH15P55291 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH15P55291 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH15P55291 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH15P55291 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH15P55291 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH15P55291 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH15P55291 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH15P55291 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH15P55291 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH15P55291 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH15P55291 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH15P55291 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH15P55291 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH15P55291 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH15P55291 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH15P55291 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH15P55291 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH15P55291 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH15P55291 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH15P55291 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH15P55291 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms