Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH13P55290 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH13P55290 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH13P55290 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH13P55290 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH13P55290 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH13P55290 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH13P55290 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH13P55290 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH13P55290 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH13P55290 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH13P55290 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH13P55290 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH13P55290 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH13P55290 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH13P55290 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH13P55290 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH13P55290 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH13P55290 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH13P55290 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH13P55290 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH13P55290 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH13P55290 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH13P55290 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH13P55290 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH13P55290 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH13P55290 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH13P55290 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH13P55290 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH13P55290 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH13P55290 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH13P55290 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH13P55290 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDH13P55290 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH13P55290 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH13P55290 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH13P55290 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH13P55290 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH13P55290 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH13P55290 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH13P55290 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH13P55290 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH13P55290 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH13P55290 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH13P55290 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH13P55290 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH13P55290 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH13P55290 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH13P55290 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH13P55290 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH13P55290 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH13P55290 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH13P55290 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH13P55290 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms