Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IST1P53990 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IST1P53990 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IST1P53990 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IST1P53990 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IST1P53990 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IST1P53990 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IST1P53990 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IST1P53990 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IST1P53990 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IST1P53990 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IST1P53990 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IST1P53990 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IST1P53990 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IST1P53990 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IST1P53990 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IST1P53990 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IST1P53990 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IST1P53990 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IST1P53990 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IST1P53990 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IST1P53990 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IST1P53990 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IST1P53990 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IST1P53990 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IST1P53990 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IST1P53990 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IST1P53990 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IST1P53990 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IST1P53990 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IST1P53990 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IST1P53990 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IST1P53990 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IST1P53990 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IST1P53990 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IST1P53990 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IST1P53990 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IST1P53990 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IST1P53990 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IST1P53990 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IST1P53990 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IST1P53990 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IST1P53990 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IST1P53990 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IST1P53990 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IST1P53990 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IST1P53990 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IST1P53990 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IST1P53990 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IST1P53990 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IST1P53990 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IST1P53990 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IST1P53990 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IST1P53990 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IST1P53990 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IST1P53990 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IST1P53990 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IST1P53990 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IST1P53990 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IST1P53990 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IST1P53990 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IST1P53990 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IST1P53990 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IST1P53990 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IST1P53990 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IST1P53990 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IST1P53990 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IST1P53990 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IST1P53990 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IST1P53990 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IST1P53990 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IST1P53990 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IST1P53990 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IST1P53990 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IST1P53990 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IST1P53990 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IST1P53990 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IST1P53990 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IST1P53990 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms