Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2KP53803 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2KP53803 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms