Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP98P52948 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP98P52948 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP98P52948 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP98P52948 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP98P52948 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP98P52948 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP98P52948 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP98P52948 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUP98P52948 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP98P52948 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP98P52948 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP98P52948 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP98P52948 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP98P52948 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP98P52948 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP98P52948 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP98P52948 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP98P52948 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP98P52948 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP98P52948 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP98P52948 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP98P52948 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP98P52948 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP98P52948 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUP98P52948 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP98P52948 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP98P52948 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUP98P52948 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP98P52948 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP98P52948 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP98P52948 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP98P52948 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP98P52948 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP98P52948 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP98P52948 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP98P52948 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP98P52948 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP98P52948 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP98P52948 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP98P52948 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP98P52948 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP98P52948 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP98P52948 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP98P52948 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP98P52948 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP98P52948 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP98P52948 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP98P52948 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP98P52948 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP98P52948 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP98P52948 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP98P52948 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP98P52948 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP98P52948 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP98P52948 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP98P52948 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP98P52948 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP98P52948 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP98P52948 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP98P52948 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP98P52948 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP98P52948 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP98P52948 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP98P52948 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP98P52948 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP98P52948 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP98P52948 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP98P52948 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP98P52948 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP98P52948 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP98P52948 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP98P52948 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP98P52948 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUP98P52948 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP98P52948 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP98P52948 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP98P52948 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP98P52948 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP98P52948 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP98P52948 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP98P52948 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP98P52948 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP98P52948 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP98P52948 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP98P52948 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP98P52948 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP98P52948 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP98P52948 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP98P52948 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms