Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF138P52744 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF138P52744 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms