Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNHP51946 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNHP51946 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNHP51946 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNHP51946 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNHP51946 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNHP51946 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNHP51946 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNHP51946 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNHP51946 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNHP51946 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNHP51946 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNHP51946 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNHP51946 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNHP51946 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNHP51946 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNHP51946 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNHP51946 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNHP51946 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNHP51946 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNHP51946 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNHP51946 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNHP51946 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNHP51946 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNHP51946 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNHP51946 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNHP51946 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNHP51946 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNHP51946 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNHP51946 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNHP51946 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNHP51946 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNHP51946 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNHP51946 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNHP51946 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNHP51946 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNHP51946 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNHP51946 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNHP51946 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNHP51946 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNHP51946 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNHP51946 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNHP51946 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNHP51946 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNHP51946 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNHP51946 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNHP51946 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNHP51946 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNHP51946 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNHP51946 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNHP51946 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNHP51946 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNHP51946 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNHP51946 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNHP51946 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNHP51946 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNHP51946 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNHP51946 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNHP51946 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNHP51946 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNHP51946 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNHP51946 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNHP51946 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNHP51946 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNHP51946 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNHP51946 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNHP51946 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.4 ms